RDS認證申請流程可分為五個關鍵階段，每一步都需嚴格按照標準執行。第一階段是聯繫認證機構，提交企業基本信息與認證意向，機構會根據企業規模與產品類型提供初步評估。第二階段為文件審核，企業需提交供應鏈追溯記錄、原料證明、質量管理手冊等文件，認證機構將在1 - 2周內反饋審核意見，並列出需補充的資料。第三階段是報價與合約簽訂，企業確認審核範圍後，機構出具費用報價單，雙方簽訂認證服務合約，合約有效期通常為一年。第四階段為現場審核，認證機構將派遣審核員到企業生產場地進行實地檢查，重點核查原料追溯系統、生產車間隔離措施、員工操作規範等，審核時間一般為1 - 3天。第五階段是證書頒發，若審核通過，企業將在2周內收到RDS認證證書；若存在不符合項，需在規定時間內完成整改並申請複審。